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據說這座城堡是淺井亮政在大永時代早期（1520 年代早期）建造的，但具體時間不詳。城堡建在湖北部的戰略要地小谷山上，淺井氏的三代人 Ryomasa、Hisamasa 和 Nagamasa 都曾在此居住。但是，1573 年（天正 1 年），淺井城遭到織田信長的攻擊而陷落，淺井氏也隨之滅亡。城破後，木下藤一郎秀吉於同年 4 月遷居長濱，此後該城被廢棄。現在的城堡遺址包括主城遺跡、洗馬池和櫻場，石墩依然存在。 淺井長政（1545-73 年）是東淺井郡小谷城的城主。他娶了信長的妹妹大市為妻，但在信長攻打朝倉氏時，他仍與信長結盟，並在姉川與信長交戰，被信長擊敗。信長隨後包圍了淺倉城，並與其父久政一同自殺。 淀殿（1567-1615 年）是小谷城主淺井長政的女兒。她是織田信長妹妹織之方的母親，父母死後，她成為秀吉的妾室，並生下了秀賴。然而，她在大阪城內反抗家康時自殺身亡。